企业推行财务预算管理以来，通过加强预算管理执行情况审计，使企业的财务预算管理状况有了较明显的转变。主要表现在;收入和支出结构逐渐趋于合理;资金预算收支运行平稳;各类违纪违规问题呈逐年下降的趋势。其突出表现是财务预算管理不到位、资金管理“松散性”较大，预算审计制度形同虚设。从目前审计实践上看，主要存在以下问题:
1. 组织形式有待创新。当前，从组织形式上看，审计框架还不能完全适应财务预算管理要求，在审计实践中还没能做到统一调配审计力量、统一部署实施方案，并形成合力，加上目前审计人员较少，力量不足，导致财务预算审计力度不够。
2. 审计制度有待建立。目前的大多数企业集团公司尚未建立健全财务预算管理审计制度，没有把财务预算审计制度作为监督组织生产经营活动的一项重要内容。有章不循、随意更改预算的现象时有发生，这种情况如果持续下去，极容易使财务预算管理成为一个“花架子”。
3. 审计手段有待转变。传统的审计方法都以手工为主，技术上、操作上都已经不能适应财务会计电算化的需要，显现出较为明显的滞后性，需要我们尽快采用先进的计算机技术，从而提高审计质量，扩大审计成果。
4. 审计内容有待完善。目前，集团总部审计没有与延伸审计下级预算部门有机结合，“同级审”与“上审下”不衔接，内部审计与外部专业审计又相互脱节，使集团财务资金的走向难以把握，不利于由上到下、从下及上，从宏观及微观两个方面反映和分析预算执行及管理中出现的深层次问题，也就很难确保财务预算执行的有效性和完整性。
5. 工作机制有待健全。目前，企业集团本部的日常财务预算管理工作中，往往是生产预算控制较好，而采购预算、特别是销售预算执行情况较差;成本预算、资本支出预算控制较好，而费用预算、资金预算控制较差，这种不健全的财务预算体系往往顾此失彼，极大地损害了职能部门和员工的工作积极性，影响了企业集团财务目标的实现。究其原因之一是缺乏一个有效的对财务预算管理进行审计的工作机制。
此外，由于一些部门和下属单位在思想上对财务预算管理审计的重要性认识不足，导致在收入方面对非经营性收入监管不力等，在支出方面有的甚至置企业集团的整体利益于不顾，违规违纪行为较多。如在专项资金管理中，一些专项支出预算不能严格按照用款项目、金额执行，使用混乱、挪用生产经营资金从事长期投资的现象屡有发生，使预算失去应有的时效性和严肃性，给预算执行带来较大的随意性和盲目性。
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