控制主体的分层主要是针对公司制企业而言的，这主要是因为在独资或合伙制企业组织形式下，所有权和经营权主体基本是合二为一的，具有不可分性，企业的财务权自然也具有不可分性。
首先，出资者作为企业的所有者，在公司制企业所有权和经营权两权分离的模式下，为确保其资本保值、增值及收益分配的实现，主要行使财务监控权力来约束经营者的财务行为，以保证资本安全和增值。
具体而言包括：基于防止所有权稀释的筹资决策;基于保护出资人权益的对外投资决策;基于企业合并、分立、撤消、清算的资本变动决策;基于追求资本增值的利益分配决策。
其次，经营者享有企业直接经营权，为保证法人财产的完整和高效运作，必须全面直接地参与企业各项财务决策，主要由董事会和总经理(CEO)为代表的经理层组成。根据我国《公司法》有关规定，董事会由创立大会或股东大会选举产生，是公司的法定代表，是公司的最高决策和领导机构，全方位负责财务决策与控制，从本质上决定公司的财务状况。具体而言包括：制定财务战略、批准有效财务预测、向股东大会报告财务状况、聘任和解聘财务部经理、组织协调财务关系。
再次，以企业财务副总为首的企业财务管理部门，承担着企业绝大部分具体财务管理事务，是专门的财务管理机构。其主要职责包括：一是负责企业日常账务处理，保证财务的准确、及时和连贯性;二是制定和完善企业内部财务制度，规范企业内部财务行为开展财务分析，实施企业内部财务监控职能。
目前，有相当一部分企业对建立内部财务制度不够重视。制度建设是财务管理的基础，没有制度就无法按章行事，管理就失去了标准。因此，建立健全内部财务管理制度是企业内部监督的重要环节，应引起高度重视。
一是基本业务程序制度。财务管理是一个严格的程序性管理过程，稍不合理的设置就会影响财务管理的效率，实践中包括：财务计划的编制、调整办法;资金、成本费用、销售、利润预测的操作和结果反馈程序;资本管理办法;应收账款的登记、核对、清理和保管制度;投资方案、投资项目的可行性分析程序;销售结算、退回、折扣、折让管理;财务分析的内部指标体系、分析方法、分析要求、组织与报告程序等。
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