专用发票除具有普通发票的功能与作用外，还是纳税人计算应纳税额的重要凭证，与普通发票相比，它有以下区别：
(一)使用范围不同
专用发票一般用于一般纳税人之间从事生产经营增值税应税项目使用;而普通发票则可以用于所有纳税人的所有经营活动，当然也包括一般纳税人生产经营增值税应税项目。
(二)作用不同
普通发票只是一种商事凭证，而专用发票不仅是一种商事凭证，还是一种扣税凭证。
(三)票面反映内容不同
专用发票不但要包括普通发票所记载的内容，而且还要记录购销双方的税务登记号、地址、电话、银行帐户和税额等。
(四)联次不同
专用发票不仅要有普通发票的联次，而且还要有扣税联。
(五)反映的价格不同
普通发票反映的价格是含税价，税款与价格不分离;专用发票反映的是不含税价，税款与价格分开填列。
增值税小规模纳税人和非增值税纳税人，不得领购使用增值税专用发票。所以，开出普通发票和专用发票计算增值税都是一样的，但开专用发票，购货方符合抵扣条件的(比如购货方是一般纳税人，在规定的期限认证抵扣，购买的不是不得抵扣的货物等)，进项税额可以抵扣，而开普通发票，除农产品发票、运输发票、小规模购买税控机外，购货方都不能抵扣。
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【问】专用发票和普通发票丢失都需要登报说明吗?
【答】《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第四十一条规定，使用发票的单位和个人应当妥善保管发票，不得丢失。发票丢失，应于丢失当日书面报告主管税务机关，并在报刊和电视等传播媒介上公告声明作废。
根据《国家税务总局关于被盗、丢失增值税专用发票的处理意见的通知》(国税函[1995]292号)第二项规定，为便于各地税务机关、纳税人对照查找被盗、丢失的专用发票，减轻各地税务机关相互之间传(寄)专用发票遗失通报的工作量，对发生被盗、丢失专用发票的纳税人，必须要求统一在《中国税务报》上刊登“遗失声明”。
第三项规定，纳税人丢失专用发票后，必须按规定程序向当地主管税务机关、公安机关报失。各地税务机关对丢失专用发票的纳税人按规定进行处罚的同时，代收取“挂失登报费”，并将丢失专用发票的纳税人名称、发票份数、字轨号码、盖章与否等情况，统一传(寄)中国税务报社刊登“遗失声明”。传(寄)中国税务报社的“遗失声传(寄)中国税务报社的”遗失声明“，必须经县(市)国家税务机关审核盖章、签注意见。
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