2016年5月，新疆地区经历了一场降温、降雨、大风、沙尘和冰雹天气。据棉农反映，因频繁冷空气影响，北疆降雨多，南疆沙尘大。截至5月30日，南北疆各地的气温较历年同期，依旧偏低。终于在6月的第一天，气温回升，棉苗展开了“笑脸”。
受天气回暖影响，阿克苏、喀什等地棉农纷纷加大田间管理力度，试图将前期降温、大风沙尘、降雨造成的损害降至最低。巴楚、沙雅等棉区播种早，未受灾的棉株已长至18-20cm。当地棉农加强第二遍、三遍中耕，达到松土、通气、增温、促根壮苗、幼苗早发的效果，同时全面化控，对长势旺盛的棉田及时喷施缩节胺，对长势弱的棉田喷施叶面肥，增强抗灾能力。其次要提前预防棉铃虫、红蜘蛛、盲蝽蟓、蓟蚂等虫害大面积发生。根据天气预报，近期南疆气温整体将持续回升，6月上中旬或提前入夏，随着气温升高，虫害进入高危频发期，棉农需及时备足农药、喷施设备。
与此同时，新疆皮棉销售也因为棉市的升温出现好的迹象。南疆库尔勒、阿克苏等地80%左右的棉花加工企业皮棉已清仓，只有少数轧花厂仍在疆内仓库存有一、两批或几批低等级低品质皮棉，一方面销售和资金压力不大，在储备棉轮出成交持续火爆的拉动下，轧花厂、贸易商报价坚挺，几乎没有还盘让利的空间，但棉花品质除颜色级较好外，纤维长度、马值、断裂比强度等指标与进口储备棉、新疆储备棉相比没有任何优势;另一方面自5月3日储备棉轮出开始，内地贸易商、棉纺织厂的采购人员大多返回，采购重点转向储备棉，疆内现货批次杂、品质差异大且选择空间太小，也是买家放弃的主要原因。另外，目前现货销售仍按公检原单毛重或公定结算，对于买家而言“亏重”1%以上的情况并不少见，因为新疆棉加工期集中在10-12月份，存储到现在已半年以上，回潮变化较大，棉纺织厂希望按重新出库过磅结算，但卖方很难接受。
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